Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rnf183Q8QZS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf183Q8QZS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf183Q8QZS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf183Q8QZS5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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