Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Vrk3Q8K3G5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Vrk3Q8K3G5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Vrk3Q8K3G5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vrk3Q8K3G5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vrk3Q8K3G5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vrk3Q8K3G5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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