Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rft1Q8C3B8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms