Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FarsaQ8C0C7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FarsaQ8C0C7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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