Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY4

Pramel5, Pramel5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel5Q7TPY4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel5Q7TPY4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms