Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms