Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf9bQ6NZA9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms