Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80dQ66JY2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80dQ66JY2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms