Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20854Q62461 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms