Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DbpQ60925 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms