Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samhd1Q60710 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms