Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srek1ip1Q4V9W2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms