Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim26Q3V460 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms