Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933416C03RikQ3V063 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933416C03RikQ3V063 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms