Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrc1Q3UPH1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrc1Q3UPH1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms