Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Parp8Q3UD82 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp8Q3UD82 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms