Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp4Q3U4B1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ssbp4Q3U4B1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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