Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ulk3Q3U3Q1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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