Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem104Q3TB48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms