Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms