Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cntn3Q07409 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms