Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk18Q04899 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms