Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms