Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gbp1Q01514 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp1Q01514 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms