Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp1Q00915 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms