Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra8P70278 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stra8P70278 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms