Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3aP63011 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3aP63011 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms