Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmoP56726 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmoP56726 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmoP56726 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SmoP56726 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SmoP56726 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SmoP56726 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmoP56726 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmoP56726 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms