Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Sh3bp1P55194 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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