Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
StomP54116 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
StomP54116 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
StomP54116 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StomP54116 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StomP54116 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StomP54116 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms