Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms