Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psen1P49769 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psen1P49769 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms