Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax7P47239 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms