Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad52P43352 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad52P43352 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms