Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtgfrP43117 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms