Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbP41155 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbP41155 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbP41155 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbP41155 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbP41155 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbP41155 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbP41155 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbP41155 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LtbP41155 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms