Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msr1P30204 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms