Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa1P11477 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defa1P11477 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms