Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa2P05367 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Saa2P05367 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa2P05367 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms