Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms