Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms