Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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