Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1dO35473 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1dO35473 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1dO35473 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1dO35473 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1dO35473 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1dO35473 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1dO35473 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1dO35473 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1dO35473 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1dO35473 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1dO35473 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms