Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6871L7N248 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms