Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IfnabL7MTU6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms