Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt4B2RU40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms