Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms