Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Trabd2bB1ATG9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Trabd2bB1ATG9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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