Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms