Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Palm3A2TJV2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms